השאלה שלך מאוד מעניינת והיא שלחה אותי לחקור קצת בנבכי האינטרנט. עכשיו לפני שאני אגיד מה הדעה הרווחת אני אגיד שSSL זה בסופו של דבר סוג של חותמת גומי והאבטחה האמיתית היא ברמת הקוד והשרת ולא ה https אבל בכל אופן:
הדעה הרווחת היא שאין בעיה של אינדוקס דפי HTTPS וגם האנליטיקס עובד בהם, אולם אליה וקוץ בה, אם ניתן לגשת לדף מסוים נגיד mysite.com / x גם דרך HTTP וגם HTTPS זה יכול ליצור לך תוכן כפול! דבר שהוא הרסני מבחינת קידום, שים לב שאומנם אתה בונה תוכנית קישורים אבל אנשים יכולים לקשר אליך באופן עצמאי דרך HTTP מה שיגרום לתוכן מסוים להתאנדקס דרך 2 כתובות שונות-קטסטרופה!
עכשיו פתרונות אפשריים זה לעשות דרך ה htaccess הפנייה 301 לכל העמודים באתר שאם הם נפתחים בHTTP שישלחו לHTTPS בתקווה שגם הכח של הקישורים יעבור, אולם זה פתרון טיפה בעייתי.
מה שאתה עוד יכול לעשות זה לכתוב פקודה ברמת הקוד שתשים תג noindex במידה ונכנסו אל הדף דרך פרוטוקול HTTP.
בנוסף אתה גם יכול לכתוב ב robotstxt הוראה למנועי החיפוש לא לאנדקס עמודי HTTP.
פתרונות יש למכביר והם דורשים התעסקות ולכל אחד מהם יש גם downside לכן אם הייתי במקומך הייתי בסופו של דבר נותן לאתר להיות בפרוטוקול HTTP ורק בעמודים מסויימים כגון עמוד חשבון משתמש ועמוד רכישה לשים את פרוטוקול HTTPS מה שיהיה הרבה יותר קל לשליטה ובקרה, גם הקוד שאתה שם לעמודים אלה כדי לא להתאנדקס הוא פשוט יחסית, אם רתה צריך שלח לי מייל לiungelson@gmail.com כי האתר פה לא מרשה לי לשים אותו.
אז אולי תעדיף את הפיתרון הזה שהוא פשוט יותר, בכל אופן מאחל לך בהצלחה!